Esteve ligado tanto ao ressurgimento do movimento ambientalista nos anos 1980 – foi um dos fundadores da associação GEOTA – como da nova política ambiental, que tomou impulso na mesma década.

Esteve na Comissão Nacional para o Ano Europeu do Ambiente, no antigo Instituto Nacional do Ambiente, na Direcção Regional do Ambiente e Ordenamento do Território de Lisboa e Vale do Tejo.

Foi assessor do ministro Carlos Borrego e, mais tarde, do secretário de Estado Jorge Moreira da Silva, actual vice-presidente do PSD. Paulo Lemos desenvolveu parte do seu trabalho na área internacional, tendo passado seis anos na Representação Permanente de Portugal em Bruxelas, antes de ser chamado para o gabinete de Assunção Cristas, em 2011.

Era, actualmente, subdirector-geral da Agência Portuguesa do Ambiente – entidade que agora tutelará. Nas últimas semanas, o seu nome estava a circular como provável substituto do inspector-geral da Agricultura, Mar, Ambiente e Ordenamento do Território, que se demitiu em Dezembro.