Para além dos custos elevados, cobrados ou anunciados, nas transferências MB Way - situação que tem gerado alguma confusão em relação à existência de custos associados às outras funcionalidades, como pagamentos -, os bancos também estão a aplicar comissões elevadas às transferências imediatas, disponibilizadas desde Setembro de 2018, o que está a travar a sua utilização. O Banco de Portugal não esconde o desagrado pela estratégia de comissionamento dos bancos, que se pode virar contra eles.